Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP1A4Q13733 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP1A4Q13733 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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