Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL1Q13616 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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