Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NAE1Q13564 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NAE1Q13564 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NAE1Q13564 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NAE1Q13564 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NAE1Q13564 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NAE1Q13564 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NAE1Q13564 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NAE1Q13564 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NAE1Q13564 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NAE1Q13564 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NAE1Q13564 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NAE1Q13564 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NAE1Q13564 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NAE1Q13564 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NAE1Q13564 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NAE1Q13564 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NAE1Q13564 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NAE1Q13564 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NAE1Q13564 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NAE1Q13564 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NAE1Q13564 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NAE1Q13564 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NAE1Q13564 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NAE1Q13564 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NAE1Q13564 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NAE1Q13564 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NAE1Q13564 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NAE1Q13564 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NAE1Q13564 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NAE1Q13564 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NAE1Q13564 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NAE1Q13564 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NAE1Q13564 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NAE1Q13564 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NAE1Q13564 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NAE1Q13564 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NAE1Q13564 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NAE1Q13564 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NAE1Q13564 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NAE1Q13564 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NAE1Q13564 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NAE1Q13564 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NAE1Q13564 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NAE1Q13564 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAE1Q13564 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAE1Q13564 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NAE1Q13564 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAE1Q13564 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NAE1Q13564 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NAE1Q13564 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAE1Q13564 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NAE1Q13564 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NAE1Q13564 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NAE1Q13564 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NAE1Q13564 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NAE1Q13564 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NAE1Q13564 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NAE1Q13564 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAE1Q13564 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NAE1Q13564 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.28■■□□□ 1
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