Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRQ13535 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRQ13535 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRQ13535 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRQ13535 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRQ13535 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRQ13535 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRQ13535 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRQ13535 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRQ13535 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRQ13535 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRQ13535 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRQ13535 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRQ13535 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRQ13535 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRQ13535 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRQ13535 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRQ13535 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRQ13535 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRQ13535 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRQ13535 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRQ13535 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRQ13535 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRQ13535 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRQ13535 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRQ13535 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRQ13535 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRQ13535 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRQ13535 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRQ13535 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRQ13535 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRQ13535 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRQ13535 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRQ13535 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRQ13535 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRQ13535 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRQ13535 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRQ13535 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRQ13535 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRQ13535 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRQ13535 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRQ13535 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRQ13535 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRQ13535 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRQ13535 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRQ13535 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRQ13535 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRQ13535 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRQ13535 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRQ13535 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRQ13535 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRQ13535 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRQ13535 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRQ13535 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRQ13535 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRQ13535 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRQ13535 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRQ13535 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRQ13535 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRQ13535 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRQ13535 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRQ13535 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRQ13535 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRQ13535 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRQ13535 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRQ13535 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRQ13535 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATRQ13535 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATRQ13535 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRQ13535 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRQ13535 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRQ13535 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRQ13535 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRQ13535 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRQ13535 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRQ13535 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRQ13535 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRQ13535 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRQ13535 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRQ13535 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRQ13535 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRQ13535 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRQ13535 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRQ13535 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRQ13535 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRQ13535 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRQ13535 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRQ13535 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRQ13535 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATRQ13535 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRQ13535 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRQ13535 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRQ13535 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRQ13535 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRQ13535 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRQ13535 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRQ13535 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRQ13535 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRQ13535 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATRQ13535 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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