Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXE3Q13461 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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