Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XRCC4Q13426 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XRCC4Q13426 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XRCC4Q13426 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
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