Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PDE3BQ13370 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDE3BQ13370 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDE3BQ13370 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
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