Protein–RNA interactions for Protein: Q13217

DNAJC3, DnaJ homolog subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC3Q13217 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJC3Q13217 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC3Q13217 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms