Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP4Q13115 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP4Q13115 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DUSP4Q13115 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP4Q13115 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP4Q13115 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP4Q13115 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP4Q13115 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP4Q13115 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP4Q13115 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUSP4Q13115 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DUSP4Q13115 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP4Q13115 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
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