Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAF1Q13077 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAF1Q13077 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF1Q13077 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
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