Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHD3Q12873 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD3Q12873 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD3Q12873 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD3Q12873 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD3Q12873 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD3Q12873 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD3Q12873 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD3Q12873 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD3Q12873 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD3Q12873 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD3Q12873 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD3Q12873 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD3Q12873 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD3Q12873 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD3Q12873 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD3Q12873 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD3Q12873 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD3Q12873 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD3Q12873 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD3Q12873 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD3Q12873 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD3Q12873 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD3Q12873 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD3Q12873 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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