Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN1Q12860 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN1Q12860 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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