Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BPTFQ12830 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BPTFQ12830 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
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