Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB40BQ12829 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB40BQ12829 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB40BQ12829 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB40BQ12829 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB40BQ12829 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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RAB40BQ12829 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB40BQ12829 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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RAB40BQ12829 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB40BQ12829 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB40BQ12829 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB40BQ12829 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB40BQ12829 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB40BQ12829 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB40BQ12829 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB40BQ12829 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB40BQ12829 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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