Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMARCB1Q12824 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCB1Q12824 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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