Protein–RNA interactions for Protein: Q12765

SCRN1, Secernin-1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN1Q12765 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCRN1Q12765 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCRN1Q12765 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCRN1Q12765 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms