Protein–RNA interactions for Protein: Q12500

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9, yeastyeast

Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVL9Q12500 MDM12YOL009C 816 nt4.35□□□□□ -1.71
AVL9Q12500 IAH1YOR126C 717 nt4.35□□□□□ -1.71
AVL9Q12500 YPL025CYPL025C 558 nt4.35□□□□□ -1.71
AVL9Q12500 HMG1YML075C 3165 nt4.35□□□□□ -1.71
AVL9Q12500 YER077CYER077C 2067 nt4.34□□□□□ -1.71
AVL9Q12500 FAA1YOR317W 2103 nt4.34□□□□□ -1.71
AVL9Q12500 NAM2YLR382C 2685 nt4.34□□□□□ -1.71
AVL9Q12500 FOX2YKR009C 2703 nt4.34□□□□□ -1.71
AVL9Q12500 TEL1YBL088C 8364 nt4.34□□□□□ -1.71
AVL9Q12500 YCL068CYCL068C 783 nt4.34□□□□□ -1.71
AVL9Q12500 YDR290WYDR290W 330 nt4.34□□□□□ -1.71
AVL9Q12500 DDI2YFL061W 678 nt4.34□□□□□ -1.71
AVL9Q12500 IMP3YHR148W 552 nt4.34□□□□□ -1.71
AVL9Q12500 YAE1YJR067C 426 nt4.34□□□□□ -1.71
AVL9Q12500 EBP2YKL172W 1284 nt4.34□□□□□ -1.71
AVL9Q12500 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt4.34□□□□□ -1.71
AVL9Q12500 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt4.34□□□□□ -1.71
AVL9Q12500 TEX1YNL253W 1269 nt4.34□□□□□ -1.71
AVL9Q12500 DDI3YNL335W 678 nt4.34□□□□□ -1.71
AVL9Q12500 KAR5YMR065W 1515 nt4.34□□□□□ -1.71
AVL9Q12500 STV1YMR054W 2673 nt4.33□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 ALR2YFL050C 2577 nt4.33□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 XKS1YGR194C 1803 nt4.33□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 LYP1YNL268W 1836 nt4.33□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 YFR045WYFR045W 930 nt4.33□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 CTL1YMR180C 963 nt4.33□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 RRN9YMR270C 1098 nt4.33□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 PRX1YBL064C 786 nt4.33□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 BMT2YBR141C 1014 nt4.33□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 GRX1YCL035C 333 nt4.33□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 FLO8YER109C 2400 nt4.33□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 YOL075CYOL075C 3885 nt4.33□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 SKG6YHR149C 2205 nt4.33□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 LYS2YBR115C 4179 nt4.32□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 SMF1YOL122C 1728 nt4.32□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 GZF3YJL110C 1656 nt4.32□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 LAS1YKR063C 1509 nt4.32□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 GDH2YDL215C 3279 nt4.32□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 TRM11YOL124C 1302 nt4.32□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 EFB1YAL003W 621 nt4.32□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 AAD10YJR155W 867 nt4.32□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 RDN5-1RDN5-1 121 nt4.32□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 RDN5-6RDN5-6 121 nt4.32□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 SEC72YLR292C 582 nt4.32□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 AAH1YNL141W 1044 nt4.32□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 YNL217WYNL217W 981 nt4.32□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 SSP2YOR242C 1116 nt4.32□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 INA17YPL099C 549 nt4.32□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 PBN1YCL052C 1251 nt4.32□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 SPO1YNL012W 1896 nt4.32□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 KIC1YHR102W 3243 nt4.32□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 MCP2YLR253W 1710 nt4.32□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 HCM1YCR065W 1695 nt4.32□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 POL31YJR006W 1464 nt4.31□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 BCK2YER167W 2556 nt4.31□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 snR78snR78 87 nt4.31□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 PCL2YDL127W 927 nt4.31□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 BCP1YDR361C 852 nt4.31□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 PAD1YDR538W 729 nt4.31□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 RPL24AYGL031C 468 nt4.31□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 YMR085WYMR085W 1299 nt4.31□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 TOM7YNL070W 183 nt4.31□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 PEP4YPL154C 1218 nt4.31□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 EFM2YBR271W 1260 nt4.31□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 STB3YDR169C 1542 nt4.31□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 BOI2YER114C 3123 nt4.3□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 SEN1YLR430W 6696 nt4.3□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 RRI1YDL216C 1323 nt4.3□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 API2YDR525W 330 nt4.3□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 KEG1YFR042W 603 nt4.3□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 YIL171WYIL171W 330 nt4.3□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 YJL218WYJL218W 591 nt4.3□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 DCS1YLR270W 1053 nt4.3□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 SEC65YML105C 822 nt4.3□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 SHE1YBL031W 1017 nt4.3□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 YBL059WYBL059W 582 nt4.3□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 VPS68YOL129W 555 nt4.3□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 SRS2YJL092W 3525 nt4.29□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 VAC7YNL054W 3498 nt4.29□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 THS1YIL078W 2205 nt4.29□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 CNB1YKL190W 528 nt4.29□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 YML031C-AYML031C-A 336 nt4.29□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 PNT1YOR266W 1272 nt4.29□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 YOR314WYOR314W 330 nt4.29□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 UBS1YBR165W 834 nt4.29□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 AZR1YGR224W 1842 nt4.29□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 UBP6YFR010W 1500 nt4.29□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 YSH1YLR277C 2340 nt4.29□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 SWP82YFL049W 1872 nt4.28□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 TDA3YHR009C 1572 nt4.28□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 RIT1YMR283C 1542 nt4.28□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 snR7-LsnR7-L 214 nt4.28□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 OKP1YGR179C 1221 nt4.28□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 YJL028WYJL028W 336 nt4.28□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 YJR056CYJR056C 711 nt4.28□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 MMM1YLL006W 1281 nt4.28□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 SWC7YLR385C 399 nt4.28□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 ALE1YOR175C 1860 nt4.28□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 ULS1YOR191W 4860 nt4.28□□□□□ -1.72
AVL9Q12500 EMP47YFL048C 1338 nt4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.9 ms