Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 UPC2YDR213W 2742 nt4.29□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 MRP4YHL004W 1185 nt4.29□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 YJR038CYJR038C 363 nt4.29□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 YDC1YPL087W 954 nt4.29□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 PBN1YCL052C 1251 nt4.29□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 XKS1YGR194C 1803 nt4.28□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 YOL075CYOL075C 3885 nt4.28□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 REX3YLR107W 1215 nt4.28□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 snR37snR37 386 nt4.28□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 YPK9YOR291W 4419 nt4.28□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 OSH2YDL019C 3852 nt4.28□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 RAD1YPL022W 3303 nt4.28□□□□□ -1.72
VPS54Q12071 NUP133YKR082W 3474 nt4.27□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 NAM9YNL137C 1461 nt4.27□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 HSP30YCR021C 999 nt4.27□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 RPP1AYDL081C 321 nt4.27□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 CPR3YML078W 549 nt4.27□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 VPS21YOR089C 633 nt4.27□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 YPL025CYPL025C 558 nt4.27□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 ULS1YOR191W 4860 nt4.27□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 FAA1YOR317W 2103 nt4.27□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 KRE29YER038C 1395 nt4.27□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 BCH2YKR027W 2298 nt4.26□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 UBP6YFR010W 1500 nt4.26□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 ARO9YHR137W 1542 nt4.26□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 UTP6YDR449C 1323 nt4.26□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 HCM1YCR065W 1695 nt4.26□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 YDL241WYDL241W 372 nt4.26□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 IRC22YEL001C 678 nt4.26□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 WSS1YHR134W 810 nt4.26□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 OAR1YKL055C 837 nt4.26□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 CUZ1YNL155W 825 nt4.26□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 MET16YPR167C 786 nt4.26□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 UGA3YDL170W 1587 nt4.26□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 SYF1YDR416W 2580 nt4.25□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 GRX6YDL010W 696 nt4.25□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 IRC6YFR043C 714 nt4.25□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 YHB1YGR234W 1200 nt4.25□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 SAY1YGR263C 1275 nt4.25□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 YML116W-AYML116W-A 303 nt4.25□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 YMR084WYMR084W 789 nt4.25□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 RNA1YMR235C 1224 nt4.25□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 YMR1YJR110W 2067 nt4.25□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 MET17YLR303W 1335 nt4.24□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 HMS1YOR032C 1305 nt4.24□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 CLB5YPR120C 1308 nt4.24□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 MDM38YOL027C 1722 nt4.24□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 ECM34YHL043W 513 nt4.24□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 YIL089WYIL089W 618 nt4.24□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 AAD10YJR155W 867 nt4.24□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 SWC7YLR385C 399 nt4.24□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 AIM39YOL053W 1188 nt4.24□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 IDI1YPL117C 867 nt4.24□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 POS5YPL188W 1245 nt4.24□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 YPR059CYPR059C 387 nt4.24□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 SWP82YFL049W 1872 nt4.24□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 ALE1YOR175C 1860 nt4.24□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 PMC1YGL006W 3522 nt4.23□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 SEC2YNL272C 2280 nt4.23□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 YCR101CYCR101C 549 nt4.23□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 BUD16YEL029C 939 nt4.23□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 BIO2YGR286C 1128 nt4.23□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 HRT1YOL133W 366 nt4.23□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 INA17YPL099C 549 nt4.23□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 YNR065CYNR065C 3351 nt4.23□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 PHO87YCR037C 2772 nt4.22□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 ELO2YCR034W 1044 nt4.22□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 MAF1YDR005C 1188 nt4.22□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 SDT1YGL224C 843 nt4.22□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt4.22□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 CIR1YGR207C 786 nt4.22□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 YKL177WYKL177W 339 nt4.22□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 MMM1YLL006W 1281 nt4.22□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 YPT53YNL093W 663 nt4.22□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 YOL024WYOL024W 519 nt4.22□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 WRS1YOL097C 1299 nt4.22□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 NUG1YER006W 1563 nt4.22□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 SPO1YNL012W 1896 nt4.22□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 EMP47YFL048C 1338 nt4.21□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 BCK2YER167W 2556 nt4.21□□□□□ -1.73
VPS54Q12071 snR7-LsnR7-L 214 nt4.21□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 YHP1YDR451C 1062 nt4.21□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 YGR219WYGR219W 342 nt4.21□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 PEX21YGR239C 867 nt4.21□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 YHL045WYHL045W 348 nt4.21□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 EOS1YNL080C 1101 nt4.21□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 RPS19AYOL121C 435 nt4.21□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 CNS1YBR155W 1158 nt4.21□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 SLX1YBR228W 915 nt4.21□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 VID28YIL017C 2766 nt4.21□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 SRO9YCL037C 1305 nt4.21□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 MSN4YKL062W 1893 nt4.2□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 GWT1YJL091C 1473 nt4.2□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 HMG1YML075C 3165 nt4.2□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 MSS2YDL107W 1056 nt4.2□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 SPC19YDR201W 498 nt4.2□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 RMD5YDR255C 1266 nt4.2□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 COX4YGL187C 468 nt4.2□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 SOL4YGR248W 768 nt4.2□□□□□ -1.74
VPS54Q12071 RPL14AYKL006W 417 nt4.2□□□□□ -1.74
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