Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DHX9Q08211 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX9Q08211 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms