Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FMODQ06828 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FMODQ06828 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FMODQ06828 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FMODQ06828 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FMODQ06828 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FMODQ06828 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FMODQ06828 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FMODQ06828 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FMODQ06828 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FMODQ06828 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FMODQ06828 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FMODQ06828 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FMODQ06828 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FMODQ06828 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FMODQ06828 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FMODQ06828 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FMODQ06828 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FMODQ06828 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FMODQ06828 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FMODQ06828 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FMODQ06828 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FMODQ06828 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FMODQ06828 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FMODQ06828 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FMODQ06828 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FMODQ06828 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FMODQ06828 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FMODQ06828 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FMODQ06828 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FMODQ06828 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FMODQ06828 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FMODQ06828 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FMODQ06828 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FMODQ06828 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FMODQ06828 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FMODQ06828 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FMODQ06828 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FMODQ06828 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FMODQ06828 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FMODQ06828 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FMODQ06828 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FMODQ06828 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FMODQ06828 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FMODQ06828 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FMODQ06828 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FMODQ06828 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FMODQ06828 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FMODQ06828 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FMODQ06828 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FMODQ06828 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FMODQ06828 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FMODQ06828 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FMODQ06828 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FMODQ06828 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FMODQ06828 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FMODQ06828 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FMODQ06828 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FMODQ06828 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FMODQ06828 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FMODQ06828 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FMODQ06828 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FMODQ06828 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FMODQ06828 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FMODQ06828 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FMODQ06828 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FMODQ06828 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FMODQ06828 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FMODQ06828 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FMODQ06828 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FMODQ06828 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FMODQ06828 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FMODQ06828 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FMODQ06828 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FMODQ06828 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FMODQ06828 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FMODQ06828 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FMODQ06828 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FMODQ06828 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FMODQ06828 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FMODQ06828 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FMODQ06828 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FMODQ06828 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FMODQ06828 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FMODQ06828 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FMODQ06828 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FMODQ06828 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FMODQ06828 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FMODQ06828 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FMODQ06828 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FMODQ06828 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FMODQ06828 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FMODQ06828 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FMODQ06828 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FMODQ06828 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FMODQ06828 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FMODQ06828 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FMODQ06828 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FMODQ06828 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FMODQ06828 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms