Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PAX8Q06710 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAX8Q06710 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms