Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNG1Q06432 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms