Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDSRQ06136 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms