Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DEUP1Q05D60 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms