Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 VPS1YKR001C 2115 nt5.39□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 SRB7YDR308C 423 nt5.38□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 YGL214WYGL214W 486 nt5.38□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 ERG3YLR056W 1098 nt5.38□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 APS1YLR170C 471 nt5.38□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 ATG38YLR211C 681 nt5.38□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 YPL199CYPL199C 723 nt5.38□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 AKL1YBR059C 3327 nt5.38□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 RPN4YDL020C 1596 nt5.38□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 MCX1YBR227C 1563 nt5.38□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 MPH2YDL247W 1830 nt5.37□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 RAD30YDR419W 1899 nt5.37□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 NOP2YNL061W 1857 nt5.37□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 snR56snR56 88 nt5.37□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 YEL010WYEL010W 351 nt5.37□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 YER133W-AYER133W-A 342 nt5.37□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 YGL117WYGL117W 798 nt5.37□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 MMM1YLL006W 1281 nt5.37□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 TEM1YML064C 738 nt5.37□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 TRI1YMR233W 681 nt5.37□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 YNL320WYNL320W 855 nt5.37□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt5.37□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 SHE3YBR130C 1278 nt5.37□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt5.37□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 PST1YDR055W 1335 nt5.37□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 CTF13YMR094W 1437 nt5.37□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 MIG1YGL035C 1515 nt5.37□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 GGA1YDR358W 1674 nt5.37□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt5.36□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 NPY1YGL067W 1155 nt5.36□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 RPL43BYJR094W-A 279 nt5.36□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 YLR379WYLR379W 375 nt5.36□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 YNL019CYNL019C 855 nt5.36□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 YNL033WYNL033W 855 nt5.36□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 CUS2YNL286W 858 nt5.36□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 SNF8YPL002C 702 nt5.36□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 HSP26YBR072W 645 nt5.36□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 TUB2YFL037W 1374 nt5.36□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 RAD28YDR030C 1521 nt5.36□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 BUD7YOR299W 2241 nt5.36□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 KGD1YIL125W 3045 nt5.35□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 CYK3YDL117W 2658 nt5.35□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 YTA6YPL074W 2265 nt5.35□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 STR2YJR130C 1920 nt5.35□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 NOC4YPR144C 1659 nt5.35□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 ERT1YBR239C 1590 nt5.35□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 SPT14YPL175W 1359 nt5.35□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 YGR079WYGR079W 1113 nt5.35□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 CKA1YIL035C 1119 nt5.35□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 YKL107WYKL107W 930 nt5.35□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 YNR061CYNR061C 660 nt5.35□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 PDX3YBR035C 687 nt5.35□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 APC4YDR118W 1959 nt5.35□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 ZPR1YGR211W 1461 nt5.34□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 ERG4YGL012W 1422 nt5.34□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 SUP45YBR143C 1314 nt5.34□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.34□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt5.34□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 YKL202WYKL202W 582 nt5.34□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 YAR069CYAR069C 294 nt5.34□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 SFH1YLR321C 1281 nt5.34□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 YHR202WYHR202W 1809 nt5.34□□□□□ -1.55
HRQ1Q05549 MOT2YER068W 1764 nt5.34□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 CIK1YMR198W 1785 nt5.34□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 MIC60YKR016W 1623 nt5.34□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 KTR7YIL085C 1554 nt5.33□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 ADE6YGR061C 4077 nt5.33□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 TUB3YML124C 1338 nt5.33□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 ISC10YER180C 804 nt5.33□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 PRP21YJL203W 843 nt5.33□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt5.33□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 CMR3YPR013C 954 nt5.33□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 NPL4YBR170C 1743 nt5.33□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 SMF1YOL122C 1728 nt5.32□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 CPR4YCR069W 957 nt5.32□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 YFR035CYFR035C 345 nt5.32□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 YPT6YLR262C 648 nt5.32□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 GCD7YLR291C 1146 nt5.32□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 MRPL16YBL038W 699 nt5.32□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 ERD2YBL040C 660 nt5.32□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 RAS1YOR101W 930 nt5.32□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 UAF30YOR295W 687 nt5.32□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 ATG5YPL149W 885 nt5.32□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 ECM33YBR078W 1290 nt5.32□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 NOP58YOR310C 1536 nt5.32□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 VID30YGL227W 2877 nt5.31□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 KAP114YGL241W 3015 nt5.31□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 RPS16BYDL083C 432 nt5.31□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 NRG1YDR043C 696 nt5.31□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 PDS1YDR113C 1122 nt5.31□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 PDE1YGL248W 1110 nt5.31□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 DAM1YGR113W 1032 nt5.31□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 YKL162CYKL162C 1209 nt5.31□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 YIM1YMR152W 1098 nt5.31□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 ENV9YOR246C 993 nt5.31□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 FDH2YPL275W 711 nt5.31□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 snR32snR32 188 nt5.31□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 YCL007CYCL007C 393 nt5.31□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 OCT1YKL134C 2319 nt5.31□□□□□ -1.56
HRQ1Q05549 POL31YJR006W 1464 nt5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15 ms