Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMX2Q04743 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EMX2Q04743 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EMX2Q04743 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms