Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 RKM3YBR030W 1659 nt4.73□□□□□ -1.65
SYF1Q04048 PUF2YPR042C 3228 nt4.72□□□□□ -1.65
SYF1Q04048 RIM21YNL294C 1602 nt4.72□□□□□ -1.65
SYF1Q04048 PUT2YHR037W 1728 nt4.72□□□□□ -1.65
SYF1Q04048 YBR225WYBR225W 2703 nt4.72□□□□□ -1.65
SYF1Q04048 SPC19YDR201W 498 nt4.72□□□□□ -1.65
SYF1Q04048 FMP33YJL161W 543 nt4.72□□□□□ -1.65
SYF1Q04048 YIM1YMR152W 1098 nt4.72□□□□□ -1.65
SYF1Q04048 SSH1YBR283C 1473 nt4.72□□□□□ -1.65
SYF1Q04048 HSP82YPL240C 2130 nt4.72□□□□□ -1.65
SYF1Q04048 TRF5YNL299W 1929 nt4.72□□□□□ -1.65
SYF1Q04048 THI7YLR237W 1797 nt4.71□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 RCM1YNL022C 1473 nt4.71□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 SFH5YJL145W 885 nt4.71□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 YAE1YJR067C 426 nt4.71□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 SPC3YLR066W 555 nt4.71□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 GLN4YOR168W 2430 nt4.71□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 GRC3YLL035W 1899 nt4.71□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 YDL032WYDL032W 312 nt4.7□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 THI13YDL244W 1023 nt4.7□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 HIS6YIL020C 786 nt4.7□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt4.7□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 THI11YJR156C 1023 nt4.7□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 IMP1YMR150C 573 nt4.7□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 TRM44YPL030W 1704 nt4.69□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 TYR1YBR166C 1359 nt4.69□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 EDC1YGL222C 528 nt4.69□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 ADD66YKL206C 804 nt4.69□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 ERD2YBL040C 660 nt4.69□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 SSB1YDL229W 1842 nt4.69□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 BOP2YLR267W 1713 nt4.69□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 GDE1YPL110C 3672 nt4.68□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 MDM34YGL219C 1380 nt4.68□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 PRP19YLL036C 1512 nt4.68□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 YPL260WYPL260W 1656 nt4.68□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 STV1YMR054W 2673 nt4.68□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 YDR230WYDR230W 348 nt4.68□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 TFB3YDR460W 966 nt4.68□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 FES1YBR101C 873 nt4.68□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 VBA2YBR293W 1425 nt4.68□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 TCB3YML072C 4638 nt4.68□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 BOI2YER114C 3123 nt4.68□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 RAD7YJR052W 1698 nt4.67□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 RTK1YDL025C 1863 nt4.67□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 YDL071CYDL071C 375 nt4.67□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 ERG20YJL167W 1059 nt4.67□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 TDA5YLR426W 981 nt4.67□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 RPS19AYOL121C 435 nt4.67□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 CBP3YPL215W 1008 nt4.67□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 CEX1YOR112W 2286 nt4.67□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 SAT4YCR008W 1812 nt4.67□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 LRG1YDL240W 3054 nt4.66□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 IDS2YJL146W 1410 nt4.66□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 PEP5YMR231W 3090 nt4.66□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 SPO16YHR153C 597 nt4.66□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 YMR130WYMR130W 909 nt4.66□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 RNA1YMR235C 1224 nt4.66□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 SRS2YJL092W 3525 nt4.66□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 CDC15YAR019C 2925 nt4.66□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 HOM3YER052C 1584 nt4.65□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 TAF12YDR145W 1620 nt4.65□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 NAM9YNL137C 1461 nt4.65□□□□□ -1.66
SYF1Q04048 PHO13YDL236W 939 nt4.65□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 DUO1YGL061C 744 nt4.65□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 TTI2YJR136C 1266 nt4.65□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 YLR049CYLR049C 1287 nt4.65□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 RPL18BYNL301C 561 nt4.65□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 PBN1YCL052C 1251 nt4.65□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 UTP6YDR449C 1323 nt4.65□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 ABD1YBR236C 1311 nt4.65□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 MDM30YLR368W 1797 nt4.65□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 YMR1YJR110W 2067 nt4.65□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 FAR10YLR238W 1437 nt4.64□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 PPQ1YPL179W 1650 nt4.64□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 RPG1YBR079C 2895 nt4.64□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 MNN1YER001W 2289 nt4.64□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 CDA2YLR308W 939 nt4.64□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 SHE3YBR130C 1278 nt4.64□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 OM14YBR230C 405 nt4.64□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 OPT2YPR194C 2634 nt4.64□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 ALE1YOR175C 1860 nt4.64□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 GIP4YAL031C 2283 nt4.63□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 FDC1YDR539W 1512 nt4.63□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 SPO1YNL012W 1896 nt4.63□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 UGA3YDL170W 1587 nt4.63□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 YDL094CYDL094C 510 nt4.63□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 NSE3YDR288W 912 nt4.63□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 SCL1YGL011C 759 nt4.63□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 GVP36YIL041W 981 nt4.63□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 HIS5YIL116W 1158 nt4.63□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 BCH2YKR027W 2298 nt4.63□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 RAD4YER162C 2265 nt4.62□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 SDS3YIL084C 984 nt4.62□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 CPR3YML078W 549 nt4.62□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 YMR084WYMR084W 789 nt4.62□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 YPL025CYPL025C 558 nt4.62□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 snR37snR37 386 nt4.62□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 EFM2YBR271W 1260 nt4.62□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 PRD1YCL057W 2139 nt4.62□□□□□ -1.67
SYF1Q04048 MDM38YOL027C 1722 nt4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.5 ms