Protein–RNA interactions for Protein: Q03519

TAP2, Antigen peptide transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP2Q03519 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAP2Q03519 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAP2Q03519 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAP2Q03519 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAP2Q03519 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAP2Q03519 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAP2Q03519 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TAP2Q03519 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TAP2Q03519 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TAP2Q03519 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAP2Q03519 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TAP2Q03519 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAP2Q03519 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAP2Q03519 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAP2Q03519 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAP2Q03519 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TAP2Q03519 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TAP2Q03519 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAP2Q03519 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAP2Q03519 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TAP2Q03519 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAP2Q03519 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAP2Q03519 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAP2Q03519 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAP2Q03519 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAP2Q03519 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TAP2Q03519 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TAP2Q03519 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TAP2Q03519 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAP2Q03519 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TAP2Q03519 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TAP2Q03519 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TAP2Q03519 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TAP2Q03519 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TAP2Q03519 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAP2Q03519 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAP2Q03519 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAP2Q03519 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAP2Q03519 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms