Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TAP1Q03518 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAP1Q03518 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms