Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC25A11Q02978 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A11Q02978 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.7 ms