Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NHLH2Q02577 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NHLH2Q02577 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms