Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TNFRSF17Q02223 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF17Q02223 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms