Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDK6Q00534 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK6Q00534 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms