Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX1P83916 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX1P83916 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX1P83916 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX1P83916 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX1P83916 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX1P83916 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX1P83916 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX1P83916 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX1P83916 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX1P83916 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX1P83916 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX1P83916 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX1P83916 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX1P83916 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX1P83916 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX1P83916 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX1P83916 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX1P83916 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX1P83916 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX1P83916 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX1P83916 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX1P83916 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX1P83916 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX1P83916 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX1P83916 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX1P83916 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX1P83916 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX1P83916 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX1P83916 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX1P83916 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX1P83916 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX1P83916 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX1P83916 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX1P83916 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX1P83916 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX1P83916 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX1P83916 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX1P83916 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX1P83916 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX1P83916 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX1P83916 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX1P83916 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX1P83916 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX1P83916 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX1P83916 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX1P83916 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX1P83916 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX1P83916 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX1P83916 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX1P83916 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX1P83916 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX1P83916 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBX1P83916 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CBX1P83916 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CBX1P83916 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBX1P83916 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CBX1P83916 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CBX1P83916 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBX1P83916 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CBX1P83916 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBX1P83916 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CBX1P83916 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX1P83916 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX1P83916 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX1P83916 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX1P83916 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX1P83916 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX1P83916 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX1P83916 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX1P83916 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX1P83916 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX1P83916 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX1P83916 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX1P83916 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX1P83916 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX1P83916 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX1P83916 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX1P83916 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX1P83916 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX1P83916 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX1P83916 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX1P83916 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX1P83916 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX1P83916 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX1P83916 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX1P83916 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX1P83916 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX1P83916 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX1P83916 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX1P83916 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX1P83916 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX1P83916 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX1P83916 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX1P83916 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX1P83916 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX1P83916 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX1P83916 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX1P83916 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX1P83916 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms