Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG7P83436 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG7P83436 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG7P83436 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG7P83436 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG7P83436 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG7P83436 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG7P83436 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG7P83436 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COG7P83436 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG7P83436 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG7P83436 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG7P83436 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG7P83436 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG7P83436 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG7P83436 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG7P83436 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COG7P83436 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COG7P83436 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COG7P83436 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
COG7P83436 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COG7P83436 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COG7P83436 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COG7P83436 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COG7P83436 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG7P83436 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG7P83436 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG7P83436 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COG7P83436 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COG7P83436 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG7P83436 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG7P83436 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG7P83436 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG7P83436 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG7P83436 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG7P83436 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG7P83436 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG7P83436 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG7P83436 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG7P83436 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG7P83436 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG7P83436 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG7P83436 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG7P83436 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG7P83436 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG7P83436 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG7P83436 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG7P83436 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG7P83436 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG7P83436 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG7P83436 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COG7P83436 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG7P83436 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG7P83436 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG7P83436 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG7P83436 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG7P83436 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG7P83436 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG7P83436 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG7P83436 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG7P83436 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG7P83436 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG7P83436 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG7P83436 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG7P83436 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG7P83436 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG7P83436 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG7P83436 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG7P83436 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG7P83436 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG7P83436 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG7P83436 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG7P83436 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG7P83436 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG7P83436 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG7P83436 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG7P83436 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG7P83436 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG7P83436 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG7P83436 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG7P83436 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG7P83436 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG7P83436 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG7P83436 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG7P83436 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COG7P83436 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG7P83436 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG7P83436 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COG7P83436 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG7P83436 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG7P83436 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG7P83436 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COG7P83436 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG7P83436 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG7P83436 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG7P83436 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG7P83436 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG7P83436 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG7P83436 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG7P83436 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms