Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TMF1P82094 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TMF1P82094 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TMF1P82094 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TMF1P82094 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TMF1P82094 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
TMF1P82094 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TMF1P82094 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TMF1P82094 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TMF1P82094 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TMF1P82094 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TMF1P82094 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TMF1P82094 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TMF1P82094 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TMF1P82094 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TMF1P82094 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TMF1P82094 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TMF1P82094 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TMF1P82094 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TMF1P82094 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TMF1P82094 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TMF1P82094 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TMF1P82094 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TMF1P82094 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TMF1P82094 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TMF1P82094 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TMF1P82094 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TMF1P82094 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TMF1P82094 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TMF1P82094 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TMF1P82094 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TMF1P82094 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TMF1P82094 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TMF1P82094 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TMF1P82094 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TMF1P82094 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TMF1P82094 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TMF1P82094 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TMF1P82094 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TMF1P82094 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TMF1P82094 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TMF1P82094 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TMF1P82094 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TMF1P82094 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TMF1P82094 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TMF1P82094 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TMF1P82094 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TMF1P82094 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TMF1P82094 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TMF1P82094 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TMF1P82094 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TMF1P82094 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TMF1P82094 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
TMF1P82094 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TMF1P82094 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
TMF1P82094 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TMF1P82094 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TMF1P82094 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TMF1P82094 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TMF1P82094 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TMF1P82094 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TMF1P82094 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TMF1P82094 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TMF1P82094 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TMF1P82094 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TMF1P82094 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
TMF1P82094 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TMF1P82094 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TMF1P82094 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TMF1P82094 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TMF1P82094 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
TMF1P82094 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TMF1P82094 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TMF1P82094 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TMF1P82094 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TMF1P82094 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TMF1P82094 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TMF1P82094 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TMF1P82094 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TMF1P82094 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TMF1P82094 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
TMF1P82094 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TMF1P82094 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TMF1P82094 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TMF1P82094 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TMF1P82094 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
TMF1P82094 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TMF1P82094 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TMF1P82094 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TMF1P82094 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TMF1P82094 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TMF1P82094 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
TMF1P82094 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TMF1P82094 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TMF1P82094 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TMF1P82094 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TMF1P82094 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TMF1P82094 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TMF1P82094 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TMF1P82094 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms