Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL8P80075 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL8P80075 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL8P80075 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCL8P80075 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCL8P80075 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL8P80075 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL8P80075 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL8P80075 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL8P80075 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL8P80075 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL8P80075 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL8P80075 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL8P80075 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL8P80075 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL8P80075 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL8P80075 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL8P80075 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL8P80075 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL8P80075 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL8P80075 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCL8P80075 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCL8P80075 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCL8P80075 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCL8P80075 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCL8P80075 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCL8P80075 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCL8P80075 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCL8P80075 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCL8P80075 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCL8P80075 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCL8P80075 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCL8P80075 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCL8P80075 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCL8P80075 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCL8P80075 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCL8P80075 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCL8P80075 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCL8P80075 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCL8P80075 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCL8P80075 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCL8P80075 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCL8P80075 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL8P80075 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL8P80075 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL8P80075 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL8P80075 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL8P80075 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL8P80075 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL8P80075 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL8P80075 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL8P80075 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL8P80075 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL8P80075 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCL8P80075 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL8P80075 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL8P80075 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL8P80075 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL8P80075 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL8P80075 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL8P80075 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL8P80075 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL8P80075 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL8P80075 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL8P80075 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL8P80075 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL8P80075 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL8P80075 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL8P80075 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL8P80075 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL8P80075 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL8P80075 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL8P80075 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL8P80075 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL8P80075 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL8P80075 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL8P80075 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL8P80075 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL8P80075 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL8P80075 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL8P80075 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL8P80075 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL8P80075 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL8P80075 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL8P80075 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL8P80075 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL8P80075 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL8P80075 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL8P80075 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL8P80075 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL8P80075 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCL8P80075 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCL8P80075 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCL8P80075 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCL8P80075 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCL8P80075 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL8P80075 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL8P80075 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL8P80075 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL8P80075 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms