Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX1P78414 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX1P78414 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX1P78414 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX1P78414 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX1P78414 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX1P78414 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX1P78414 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX1P78414 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX1P78414 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX1P78414 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX1P78414 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX1P78414 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX1P78414 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX1P78414 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX1P78414 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX1P78414 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX1P78414 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX1P78414 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX1P78414 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX1P78414 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX1P78414 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX1P78414 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX1P78414 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX1P78414 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX1P78414 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX1P78414 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX1P78414 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX1P78414 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX1P78414 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX1P78414 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX1P78414 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX1P78414 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX1P78414 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX1P78414 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX1P78414 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX1P78414 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX1P78414 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX1P78414 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRX1P78414 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX1P78414 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX1P78414 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX1P78414 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX1P78414 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX1P78414 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX1P78414 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX1P78414 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRX1P78414 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX1P78414 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX1P78414 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX1P78414 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX1P78414 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX1P78414 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX1P78414 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX1P78414 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX1P78414 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX1P78414 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX1P78414 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX1P78414 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX1P78414 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX1P78414 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX1P78414 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX1P78414 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX1P78414 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX1P78414 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRX1P78414 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX1P78414 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX1P78414 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX1P78414 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX1P78414 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX1P78414 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX1P78414 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX1P78414 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX1P78414 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX1P78414 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX1P78414 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX1P78414 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX1P78414 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX1P78414 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX1P78414 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX1P78414 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX1P78414 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX1P78414 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX1P78414 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX1P78414 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX1P78414 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX1P78414 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX1P78414 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX1P78414 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX1P78414 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX1P78414 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX1P78414 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX1P78414 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX1P78414 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX1P78414 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX1P78414 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX1P78414 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX1P78414 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX1P78414 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX1P78414 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms