Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTA1P68133 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACTA1P68133 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACTA1P68133 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACTA1P68133 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACTA1P68133 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA1P68133 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA1P68133 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA1P68133 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA1P68133 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA1P68133 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA1P68133 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA1P68133 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA1P68133 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA1P68133 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA1P68133 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA1P68133 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA1P68133 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA1P68133 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA1P68133 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA1P68133 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA1P68133 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTA1P68133 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTA1P68133 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTA1P68133 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms