Protein–RNA interactions for Protein: P61812

TGFB2, Transforming growth factor beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB2P61812 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TGFB2P61812 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TGFB2P61812 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TGFB2P61812 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TGFB2P61812 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TGFB2P61812 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TGFB2P61812 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TGFB2P61812 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TGFB2P61812 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TGFB2P61812 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TGFB2P61812 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TGFB2P61812 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms