Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK11-1P61568 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK11-1P61568 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms