Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ROMO1P60602 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms