Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVPABLB-1P60509 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVPABLB-1P60509 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms