Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DEFA1P59665 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEFA1P59665 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms