Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB15P59190 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB15P59190 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB15P59190 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB15P59190 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB15P59190 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB15P59190 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB15P59190 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB15P59190 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB15P59190 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB15P59190 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB15P59190 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB15P59190 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB15P59190 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB15P59190 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB15P59190 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB15P59190 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB15P59190 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB15P59190 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB15P59190 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB15P59190 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAB15P59190 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAB15P59190 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB15P59190 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB15P59190 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB15P59190 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB15P59190 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB15P59190 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB15P59190 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB15P59190 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB15P59190 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB15P59190 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAB15P59190 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB15P59190 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB15P59190 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB15P59190 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB15P59190 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB15P59190 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAB15P59190 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB15P59190 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB15P59190 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB15P59190 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB15P59190 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB15P59190 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB15P59190 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB15P59190 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB15P59190 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB15P59190 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB15P59190 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB15P59190 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB15P59190 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB15P59190 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB15P59190 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB15P59190 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB15P59190 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB15P59190 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAB15P59190 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB15P59190 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB15P59190 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB15P59190 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB15P59190 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB15P59190 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB15P59190 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB15P59190 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB15P59190 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB15P59190 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB15P59190 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB15P59190 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB15P59190 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB15P59190 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB15P59190 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB15P59190 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB15P59190 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB15P59190 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB15P59190 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB15P59190 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB15P59190 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB15P59190 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB15P59190 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB15P59190 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB15P59190 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB15P59190 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB15P59190 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB15P59190 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB15P59190 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB15P59190 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB15P59190 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB15P59190 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB15P59190 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB15P59190 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB15P59190 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB15P59190 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB15P59190 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB15P59190 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB15P59190 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB15P59190 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB15P59190 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB15P59190 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB15P59190 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB15P59190 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms