Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP11P59045 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLRP11P59045 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms