Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX16P57768 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX16P57768 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX16P57768 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX16P57768 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX16P57768 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX16P57768 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX16P57768 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX16P57768 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX16P57768 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX16P57768 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX16P57768 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX16P57768 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX16P57768 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX16P57768 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX16P57768 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX16P57768 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX16P57768 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX16P57768 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX16P57768 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX16P57768 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX16P57768 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX16P57768 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX16P57768 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX16P57768 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX16P57768 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX16P57768 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX16P57768 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX16P57768 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX16P57768 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX16P57768 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX16P57768 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX16P57768 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX16P57768 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX16P57768 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX16P57768 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX16P57768 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX16P57768 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX16P57768 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX16P57768 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX16P57768 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX16P57768 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX16P57768 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX16P57768 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX16P57768 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX16P57768 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX16P57768 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX16P57768 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX16P57768 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX16P57768 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX16P57768 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX16P57768 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX16P57768 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX16P57768 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX16P57768 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX16P57768 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX16P57768 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX16P57768 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX16P57768 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX16P57768 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX16P57768 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX16P57768 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX16P57768 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX16P57768 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX16P57768 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX16P57768 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX16P57768 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX16P57768 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX16P57768 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX16P57768 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX16P57768 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX16P57768 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX16P57768 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX16P57768 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX16P57768 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX16P57768 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX16P57768 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX16P57768 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX16P57768 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX16P57768 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX16P57768 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX16P57768 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX16P57768 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX16P57768 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX16P57768 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX16P57768 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX16P57768 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX16P57768 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX16P57768 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX16P57768 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX16P57768 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX16P57768 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX16P57768 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX16P57768 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX16P57768 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX16P57768 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX16P57768 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX16P57768 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX16P57768 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX16P57768 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms