Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP107P57740 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP107P57740 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP107P57740 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP107P57740 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP107P57740 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP107P57740 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP107P57740 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUP107P57740 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUP107P57740 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUP107P57740 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP107P57740 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP107P57740 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP107P57740 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP107P57740 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP107P57740 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP107P57740 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP107P57740 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP107P57740 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP107P57740 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP107P57740 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP107P57740 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP107P57740 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP107P57740 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP107P57740 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUP107P57740 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP107P57740 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP107P57740 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP107P57740 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP107P57740 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP107P57740 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP107P57740 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP107P57740 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP107P57740 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP107P57740 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP107P57740 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP107P57740 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP107P57740 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP107P57740 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP107P57740 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP107P57740 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUP107P57740 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP107P57740 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP107P57740 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP107P57740 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP107P57740 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP107P57740 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP107P57740 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP107P57740 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP107P57740 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP107P57740 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP107P57740 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP107P57740 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUP107P57740 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP107P57740 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP107P57740 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP107P57740 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP107P57740 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP107P57740 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP107P57740 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP107P57740 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP107P57740 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP107P57740 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUP107P57740 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP107P57740 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP107P57740 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP107P57740 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP107P57740 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP107P57740 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP107P57740 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP107P57740 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP107P57740 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP107P57740 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP107P57740 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP107P57740 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP107P57740 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP107P57740 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP107P57740 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP107P57740 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP107P57740 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP107P57740 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP107P57740 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP107P57740 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP107P57740 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP107P57740 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP107P57740 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP107P57740 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP107P57740 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP107P57740 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP107P57740 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP107P57740 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP107P57740 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP107P57740 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP107P57740 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP107P57740 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP107P57740 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP107P57740 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP107P57740 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP107P57740 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP107P57740 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms