Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RWDD2BP57060 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RWDD2BP57060 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RWDD2BP57060 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RWDD2BP57060 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RWDD2BP57060 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RWDD2BP57060 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RWDD2BP57060 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RWDD2BP57060 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RWDD2BP57060 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RWDD2BP57060 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RWDD2BP57060 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RWDD2BP57060 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RWDD2BP57060 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RWDD2BP57060 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RWDD2BP57060 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RWDD2BP57060 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RWDD2BP57060 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RWDD2BP57060 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RWDD2BP57060 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RWDD2BP57060 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RWDD2BP57060 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RWDD2BP57060 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RWDD2BP57060 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms