Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME5P56597 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME5P56597 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME5P56597 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME5P56597 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME5P56597 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME5P56597 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME5P56597 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME5P56597 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME5P56597 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME5P56597 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME5P56597 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME5P56597 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME5P56597 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NME5P56597 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME5P56597 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME5P56597 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME5P56597 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME5P56597 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME5P56597 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME5P56597 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME5P56597 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME5P56597 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME5P56597 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME5P56597 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME5P56597 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME5P56597 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME5P56597 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME5P56597 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME5P56597 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME5P56597 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME5P56597 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME5P56597 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME5P56597 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NME5P56597 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NME5P56597 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NME5P56597 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NME5P56597 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NME5P56597 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NME5P56597 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NME5P56597 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NME5P56597 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NME5P56597 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NME5P56597 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NME5P56597 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NME5P56597 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NME5P56597 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NME5P56597 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NME5P56597 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NME5P56597 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NME5P56597 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NME5P56597 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NME5P56597 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NME5P56597 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NME5P56597 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME5P56597 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME5P56597 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME5P56597 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME5P56597 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME5P56597 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME5P56597 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME5P56597 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME5P56597 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME5P56597 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME5P56597 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME5P56597 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME5P56597 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME5P56597 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME5P56597 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME5P56597 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME5P56597 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME5P56597 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME5P56597 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME5P56597 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME5P56597 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME5P56597 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME5P56597 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME5P56597 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME5P56597 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME5P56597 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME5P56597 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME5P56597 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME5P56597 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NME5P56597 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME5P56597 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME5P56597 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME5P56597 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME5P56597 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME5P56597 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME5P56597 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME5P56597 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME5P56597 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME5P56597 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME5P56597 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME5P56597 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME5P56597 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME5P56597 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME5P56597 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME5P56597 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME5P56597 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.3 ms